Czasami, aby spółka mogła wejść w reżim estońskiego CIT musi dokonać reorganizacji. Powodem jest to, że tylko proste struktury mają możliwość wyboru tego typu opodatkowania. Proste, czyli bez holdingów, spółek-córek i z osobami fizycznymi, jako jedynymi wspólnikami. Okazuje się, że niektóre reorganizacje podejmowane w celu wyboru eCIT mogą być uznane za niedozwolone.

Zaplanowana sukcesja nie oznacza konieczności wyboru fundacji rodzinnej. Istnieje możliwość jej przeprowadzenia również w innych formułach. Jednym z rozwiązań jest darowizna udziałów w spółkach lub przystąpienie sukcesorów do spółek, przy umorzeniu udziałów seniorów. Nie zawsze jest to wyjście idealne i może generować również dodatkowe ryzyka prawno-podatkowe, m. in. pod kątem unikania opodatkowania. Jak taką reorganizację ocenia Szef Krajowej Administracji Skarbowej?